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斯坦福大学的新算法比较物种中的细胞以发现相似之处
发布时间:2021-05-28 09:09:58来源:
导读斯坦福大学的一组生物工程师开发了一种具有独特和专门功能的新算法。该算法旨在比较不同物种的细胞。该算法可以识别相似的细胞类型,而不管
斯坦福大学的一组生物工程师开发了一种具有独特和专门功能的新算法。该算法旨在比较不同物种的细胞。该算法可以识别相似的细胞类型,而不管其物种是什么,并且可以用于已经进化了数百万年的鱼类,小鼠,扁虫和海绵等生物。
新算法的目的是帮助科学家填补人类对进化的理解的空白。比较不同物种的细胞可以帮助生物学家了解细胞类型是如何产生的,以及它们如何适应不同生活中的功能。近年来,进化生物学家一直在寻求利用技术来对整个有机体中的所有细胞进行测序和鉴定。
科学家正在寻找对多种生物中所有类型的细胞进行分类的方法。斯坦福大学生物工程学助理教授王波(Bo Wang)和他的团队开发了该算法,以将相似的细胞类型跨进化距离联系起来。在研究中,研究小组使用7种不同的物种比较了21种配对,并能够鉴定出所有物种中存在的细胞类型以及它们的相似性和差异性。
该项目的首席研究员Alexander Tarashansky,他说算法的想法来自Wang教授,当时他被要求分析实验室中正在研究的两种不同蠕虫的细胞类型数据集。Tarashansky说,他对两种蠕虫之间的巨大差异感到“震惊”,尽管研究小组认为它们应该是相似的细胞类型,但用于研究它们的标准技术并未将它们识别为相似。
这个问题开始了一种算法的开发,可以更好地匹配物种间的细胞类型。新算法可以找到海绵中的一个基因与所有潜在的相应人类基因,并确定正确的基因,而不是像以前的数据匹配那样找到一对一的基因匹配。新算法将使研究人员能够收集各种物种的数据进行分析。随着时间的流逝,生物学家识别不同生物体中细胞类型轨迹的能力将会提高。
标签:斯坦福大学
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